Enhancing access to the Bibliome: the TREC 2004 Genomics Track

Hersh, William R; Bhupatiraju, Ravi Teja; Ross, Laura; Roberts, Phoebe; Cohen, Aaron M; Kraemer, Dale F

doi:10.1186/1747-5333-1-3

Journal of Biomedical Discovery and Collaboration

Table 1 Topics and associated data. Ad hoc retrieval topics, number of relevant documents, and average results for all runs.

From: Enhancing access to the Bibliome: the TREC 2004 Genomics Track

Topic	Pool	Definitely Relevant	Possibly Relevant	Not Relevant	Definitely & Possibly Relevant	MAP average	P@10 average	P@100 average
1	879	38	41	800	79	0.3073	0.7383	0.2891
2	1264	40	61	1163	101	0.0579	0.2787	0.1166
3	1189	149	32	1008	181	0.0950	0.3298	0.2040
4	1170	12	18	1140	30	0.0298	0.0894	0.0360
5	1171	5	19	1147	24	0.0564	0.1340	0.0349
6	787	41	53	693	94	0.3993	0.8468	0.3938
7	730	56	59	615	115	0.2006	0.4936	0.2704
8	938	76	85	777	161	0.0975	0.3872	0.2094
9	593	103	12	478	115	0.6114	0.7957	0.6196
10	1126	3	1	1122	4	0.5811	0.2532	0.0277
11	742	87	24	631	111	0.3269	0.5894	0.3843
12	810	166	90	554	256	0.4225	0.7234	0.5866
13	1118	5	19	1094	24	0.0288	0.1021	0.0274
14	948	13	8	927	21	0.0479	0.0894	0.0270
15	1111	50	40	1021	90	0.1388	0.2915	0.1800
16	1078	94	53	931	147	0.1926	0.4489	0.2883
17	1150	2	1	1147	3	0.0885	0.0511	0.0115
18	1392	0	1	1391	1	0.6254	0.0660	0.0072
19	1135	0	1	1134	1	0.1594	0.0362	0.0062
20	814	55	61	698	116	0.1466	0.3957	0.2238
21	676	26	54	596	80	0.2671	0.4702	0.2796
22	1085	125	85	875	210	0.1354	0.4234	0.2709
23	915	137	21	757	158	0.1835	0.3745	0.2747
24	952	7	19	926	26	0.5970	0.7468	0.1685
25	1142	6	26	1110	32	0.0331	0.1000	0.0330
26	792	35	12	745	47	0.4401	0.7298	0.2411
27	755	19	10	726	29	0.2640	0.4319	0.1355
28	836	6	7	823	13	0.2031	0.2532	0.0643
29	756	33	10	713	43	0.1352	0.1809	0.1515
30	1082	101	64	917	165	0.2116	0.4872	0.3113
31	877	0	138	739	138	0.0956	0.2489	0.2072
32	1107	441	55	611	496	0.1804	0.6085	0.4787
33	812	30	34	748	64	0.1396	0.2234	0.1647
34	778	1	30	747	31	0.0644	0.0830	0.0668
35	717	253	18	446	271	0.3481	0.8213	0.6528
36	676	164	90	422	254	0.4887	0.7638	0.6700
37	476	138	11	327	149	0.5345	0.7426	0.6564
38	1165	334	89	742	423	0.1400	0.5915	0.4043
39	1350	146	171	1033	317	0.0984	0.3936	0.2689
40	1168	134	143	891	277	0.1080	0.3936	0.2796
41	880	333	249	298	582	0.3356	0.6766	0.6521
42	1005	191	506	308	697	0.1587	0.6596	0.5702
43	739	25	170	544	195	0.1185	0.6915	0.2553
44	1224	485	164	575	649	0.1323	0.6149	0.4632
45	1139	108	48	983	156	0.0286	0.1574	0.0711
46	742	111	86	545	197	0.2630	0.7362	0.4981
47	1450	81	284	1085	365	0.0673	0.3149	0.2355
48	1121	53	102	966	155	0.1712	0.4021	0.2557
49	1100	32	41	1027	73	0.2279	0.5404	0.2049
50	1091	79	223	789	302	0.0731	0.3447	0.2534
Mean	975.1	92.6	72.8	809.7	165.4	0.2171	0.4269	0.2637
Median	978.5	54	44.5	783	115.5	0.1590	0.3989	0.2472
Min	476	0	1	298	1	0.0286	0.0362	0.0062
Max	1450	485	506	1391	697	0.6254	0.8468	0.6700

Back to article page